Le piante possono instaurare relazioni con due o tre differenti tipi di Microrganismi. Queste interazioni più complesse sono importanti per diverse piante nei sistemi agricoli, sia temperati che tropicali. Le associazioni simbiotiche furono descritte per la prima volta nel 1986.
Si conoscono molte associazioni tripartite: la pianta più endomocorriza e rizobi, che comprende Rhizobium e Bradyrhizobium; endomocorriza e attinorriza; ectomicorriza e attinorriza.
Piante micorrizate e dotate di moduli sono avvantaggiate per far fronte ad ambienti poveri di sostanze nutritive.
Esistono anche associazioni tetrapartite che consistono di endomocorrize, ectomicorrize, Frankia e la pianta ospite. Queste associazioni complesse, nonostante il dispendio energetico addizionale, forniscono importanti vantaggi alle piante.
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